Последние версии Oracle SQL Developer (4.0 и далее) требуют минимум JDK 7. Чтобы явно указать SQL Developer где находится JDK необходимо указать этот путь в конфигурационном файле product.conf (параметр SetJavaHome):

Для Windows XP: «C:\Documents and Settings\Application Data\sqldeveloper\1.0.0.0.0»
Для Vista и выше: «C:\Users\AppData\Roaming\sqldeveloper\1.0.0.0.0\»